Главная » Здоровье » Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет практически любой вирус, инфицирующий человека или животных, сообщается в результатах исследования, проведенного в Медицинской Школе Вашингтонского Университета в Сент-Луисе (Washington University School of Medicine in St. Louis, США), где разработана технология.

Известны тысячи вирусов, вызывающих заболевания человека и животных. Их диагностика может оказаться масштабной задачей, порой требующей проведения множества различных тестов. Это связано с тем, что существующие тесты недостаточно чувствительны для определения низкого уровня вирусных частиц или ограничены определением лишь тех патогенов, которые предположительно являются причиной заболевания.

«С новым тестом вам не нужно знать, что именно вы ищете, – говорит старший автор исследования Грегори Сторк (Gregory Storch), доктор медицины и профессор педиатрии, – Он охватывает широкий спектр и может эффективно выявлять вирусы, присутствующие в очень малом количестве. Мы полагаем, что этот тест будет особенно необходим в ситуациях, где диагностика остается затруднительной после проведения стандартного тестирования или ситуаций, в которых причина вспышки заболевания неизвестна».

Результаты, опубликованные в он-лайн доступе журнала Genome Research, демонстрируют, что в образцах пациентов новый тест, названный ViroCap, способен определить вирусы, не выявляемые стандартными диагностическими системами, основанными на секвенировании генома. Новая тест-система может использоваться для выявления вспышек таких смертельных вирусных заболеваний, как лихорадка Эбола или Марбурга, атипичная пневмония, а также множества обычных вирусов, включая ротавирус и норовирус, вызывающих острые желудочно-кишечные инфекции.

Новая система на основе секвенирования так же чувствительна, как метод ПЦР, являющийся «золотым стандартом» и широко использующийся в клинических лабораториях. Однако даже самый широкий анализ ПЦР позволяет провести скрининг лишь до 20 похожих вирусов единовременно.

Исследователи из Вашингтонского Университета сделают разработанную технологию доступной для ученых и врачей по всему миру на пользу пациентам и исследованиям.

Ученые оценили новую тест-систему на двух наборах биологических образцов (образцов крови, кала или секрета носа) пациентов Детской Больницы Сент-Луиса (St. Louis Children’s Hospital, США ). В первой группе референсный метод тестирования, основанный на секвенировании генома, позволил определить вирусы у 10 из 14 пациентов. Однако новый тест обнаружил вирусы и у четырех других детей. Стандартное тестирование не смогло выявить самые обычные вирусы: вирус гриппа В, вызывающий сезонную простуду, парэховирус – умеренный желудочно-кишечный и респираторный вирус, герпесвирус 1 типа, вызывающий герпес на губах, а также вирус ветряной оспы.

Во второй группе детей с необъяснимыми простудами стандартное тестирование выявило 11 вирусов у 8 обследованных. Однако новый тест позволил обнаружить еще 7, в том числе и респираторный аденовирус В человека типа 3А, обычно безвредный, но иногда вызывающий сильные инфекции у некоторых пациентов.

В итоге, число вирусов, выявленных в двух группах пациентов, возросло с 21 до 32, то есть, в данном случае, на 52%.

«Тест настолько чувствителен, что даже определяет варианты штаммов вирусов, родственных генетически, – отмечает один из авторов публикации Тодд Уайли (Todd Wylie), преподаватель педиатрии, – Небольшие генетические различия среди вирусов часто нельзя выявить доступными в настоящее время тестам».

Кроме того, в связи с тем, что тест содержит детальную генетическую информацию о различных штаммах отдельных вирусов, можно легко определить их подтипы. Например, исследование показало, что, в то время как стандартный анализ выявил вирус гриппа А, вызывающий сезонную простуду, новый метод диагностики указал, что данный вирус относится к особенно острому подтипу H3N2.

В прошлом эпидемиологическом сезоне H3N2 стал причиной некоторых из 36 тыс. смертельных случаев в США. У некоторых пациентов, в частности, у маленьких детей, пожилых людей и людей с ослабленной иммунной системой, информация о присутствии штамма H3N2 может повлиять на тактику лечения.

Для разработки теста исследователи собрали уникальные последовательности ДНК или РНК каждой из известных группы вирусов, инфицирующих человека и животных. В общей сложности исследовательская команда включила в исследование 2 млн. уникальных фрагментов генетического материала вирусов. Эти фрагменты используются в качестве проб для гибридизации генетического материала вирусов в образце. Соответствующий вирусный материал затем анализируется с использованием высокопроизводительного генетического секвенирования. При обнаружении абсолютно новых вирусов их генетический материал можно легко получить и добавить в тест-систему, отмечает Сторк.

Исследователи планируют провести дополнительные испытания для оценки точности теста, поэтому до его клинической доступности может пройти несколько лет.

«Можно модифицировать диагностическую систему так, чтобы она использовалась для определения патогенов, отличных от вирусов, как, например, бактерии, грибы и другие микроорганизмы, а также генов, указывающих на резистентность патогена к лечению антибиотиками или другими препаратами», – говорит соавтор публикации Кристин Уайли (Kristine Wylie), доктор философии, доцент педиатрии.

Todd N Wylie, Kristine M Wylie, Brandi N Herter, Gregory A Storch. Enhanced virome sequencing through solution-based capture enrichment. Genome Research, 2015; gr.191049.115 DOI: 10.1101/gr.191049.115

О admin

Оставить комментарий

Ваш email нигде не будет показанОбязательные для заполнения поля помечены *

*

x

Check Also

Гарднереллез: лечение и профилактика

Гарднереллез – это заболевание, вызванное нарушением баланса микрофлоры влагалища женщины. В норме во влагалище должна быть молочнокислая микрофлора, а при гарднереллезе среда становится щелочной. При ...

Тепловой или солнечный удар

Что такое тепловой удар? Какие признаки теплового удара? Разница между тепловым и солнечным ударом. Как избежать теплового удара? Тепловой удар возникает в результате сильного перегрева ...

Как улучшить память и внимание?

Если жена говорит, что пора бороться со старческим маразмом только потому, что в очередной раз забыли о дате годовщины свадьбы, не обращайте внимания, это не ...

Ушиб позвоночника — признаки, лечение

Ушиб в медицине считается не тяжелой травмой, полученной в результате удара. Обычно при нем происходит небольшое повреждение поверхностных тканей с возможным растяжением мышц и связок. ...

Как снять усталость ног после длительной ходьбы: причины и лечение

Причины усталости ног после длительной ходьбы, как ее снять и лечиться Когда усталость валит с ног после длительной ходьбы, необходимо уделить особое внимание своим ступням ...

Герпес при беременности — Причины и симптомы Герпеса при беременности

Герпес — это вирусная инфекция, возбудителем которой является вирус простого герпеса нескольких типов. Про герпес многие люди знают не только понаслышке. По статистике, только 5% ...

Первая помощь при огнестрельных ранениях

Порой так часто бывает, что судьба преподносит нам неприятные сюрпризы. Так например, если вас или вашего родственника или знакомого задели шальной пулей, то в первую ...

Эфирное масло чайного дерева: свойства и применение

[adrotate banner=»4″]Название, которое носит эфирное масло чайного дерева, может ввести в заблуждение. Этот препарат получают из деревьев и кустарников мелалеука, которые произрастают в Австралии, и ...

Зеленый кофе для похудения — реальные отзывы

Зеленый кофе для похудения — реальные отзывы. Стоит ли покупать зеленый кофе? За окном весна и пляжный сезон совсем скоро. Каждая женщина стремится привести себя ...

Что можно кушать на ночь худеющим, что лучше есть вечером при похудении — список продуктов

Сейчас множество людей выбирают здоровый образ жизни и, стремясь сбросить лишний вес, стараются подобрать оптимальный вечерний рацион. Какие продукты, что можно есть на ночь при ...

Трещины на сосках при кормлении грудью: как кормить при трещинах, как лечить (профилактика, крем от трещин)

Грудное вскармливание при трещинах на сосках: профилактика и лечение трещин У 10-15 % кормящих матерей с первых дней прикладывания малыша к груди обнаруживаются механические повреждения ...

Самые эффективные методы очищения печени в домашних условиях

Самые эффективные методы очищения печени в домашних условиях Одним из важнейших внутренних органов человека является печень. Именно она отвечает за очищение крови. К сожалению, из-за ...

Чтобы спиртовой компресс принес пользу, его нужно научиться ставить правильно

Почему-то когда разговор начинают про спиртовой компресс, в первую очередь на ум приходит лечение ангины. Между тем согревающий компресс используется намного шире: его можно сделать ...

Мезоморф (нормостеник) — характеристика, питание, тренировки, Похудеть легко

Какой самый выгодный тип конституции тела изобретен матушкой-природой? Американец Уильям Герберт Шелдон – основатель теории различных типов телосложения человека – утверждает, что это – мезоморф. ...

Что дать ребенку при рвоте: безопасные средства для остановки рвоты

Рвотой называют непроизвольный выброс непереваренной пищи через рот, посредством мышц живота, диафрагмы. Рвота – защитная реакция организма, желающего избавиться от токсических веществ. Судя по определению, ...

Анорексия — причины, симптомы, диагностика и лечение

Анорексия – заболевание, в основе которого лежит нервно-психическое расстройство, проявляющееся навязчивым стремлением к похуданию, страхом ожирения. Больные анорексией прибегают к потере веса с помощью диет, ...

Что такое остеопатия, что она изучает, какие болезни лечит

Основателем одного из самых удивительных медицинских направлений современности под названием «остеопатия» стал доктор Стилл. Он впервые доказал, что ограничение подвижности у человека напрямую связаны со ...

Цыпки на руках: фото, причины и лечение народными средствами

Как избавиться от цыпок на руках в домашних условиях С такой проблемой, как цыпки на руках, сегодня сталкивается каждая вторая девушка, нередко эта проблема касается ...

Голландские ученые нашли способ предотвратить старческое слабоумие

Голландские ученые нашли способ предотвратить старческое слабоумие Исследование доказывает, что внимание следует обращать не на физическую активность, а на еду и ее количество. В голландском ...

Эутиреоз щитовидной железы: причины, симптомы и лечение

Содержание Эутиреоидная патология Причины эутиреоидной патологии Симптомы эутиреоза щитовидной железы Лечение эутиреоза щитовидной железы Заболевания щитовидной железы довольно распространены и разнообразны. Причин, вызывающих их, много. ...

Головная боль справа: причины, лечение

Любая головная боль приносит человеку дискомфорт, а иногда и настоящие страдания. При появлении проблем со здоровьем лучше сразу обратиться к врачу, который назначит необходимые диагностические ...

Чем угрожает недосыпание?

Во сне мы проводим половину жизни. Здоровый и верный сон — залог удачного денька и неплохого настроения. Сколько нужно спать и к чему приводит недосыпание ...

Свойства крахмала, польза и вред

Что бы там ни говорили диетологи и любители здоровых диет, а крахмал — одно из важнейших в рационе веществ. В своё время именно начало употребления ...

Как лечить эрозию при беременности — диагностика эрозии шейки матки у беременных

Около половины женщин репродуктивного возраста сталкивается с одним из наиболее распространенных женских заболеваний – дефектом слизистой оболочки или эрозией (эктопией) шейки матки. Давайте разберемся, что ...

Рейтинг@Mail.ru