Главная » Здоровье » Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет все вирусы, инфицирующие человека и животных

Новый тест выявляет практически любой вирус, инфицирующий человека или животных, сообщается в результатах исследования, проведенного в Медицинской Школе Вашингтонского Университета в Сент-Луисе (Washington University School of Medicine in St. Louis, США), где разработана технология.

Известны тысячи вирусов, вызывающих заболевания человека и животных. Их диагностика может оказаться масштабной задачей, порой требующей проведения множества различных тестов. Это связано с тем, что существующие тесты недостаточно чувствительны для определения низкого уровня вирусных частиц или ограничены определением лишь тех патогенов, которые предположительно являются причиной заболевания.

«С новым тестом вам не нужно знать, что именно вы ищете, – говорит старший автор исследования Грегори Сторк (Gregory Storch), доктор медицины и профессор педиатрии, – Он охватывает широкий спектр и может эффективно выявлять вирусы, присутствующие в очень малом количестве. Мы полагаем, что этот тест будет особенно необходим в ситуациях, где диагностика остается затруднительной после проведения стандартного тестирования или ситуаций, в которых причина вспышки заболевания неизвестна».

Результаты, опубликованные в он-лайн доступе журнала Genome Research, демонстрируют, что в образцах пациентов новый тест, названный ViroCap, способен определить вирусы, не выявляемые стандартными диагностическими системами, основанными на секвенировании генома. Новая тест-система может использоваться для выявления вспышек таких смертельных вирусных заболеваний, как лихорадка Эбола или Марбурга, атипичная пневмония, а также множества обычных вирусов, включая ротавирус и норовирус, вызывающих острые желудочно-кишечные инфекции.

Новая система на основе секвенирования так же чувствительна, как метод ПЦР, являющийся «золотым стандартом» и широко использующийся в клинических лабораториях. Однако даже самый широкий анализ ПЦР позволяет провести скрининг лишь до 20 похожих вирусов единовременно.

Исследователи из Вашингтонского Университета сделают разработанную технологию доступной для ученых и врачей по всему миру на пользу пациентам и исследованиям.

Ученые оценили новую тест-систему на двух наборах биологических образцов (образцов крови, кала или секрета носа) пациентов Детской Больницы Сент-Луиса (St. Louis Children’s Hospital, США ). В первой группе референсный метод тестирования, основанный на секвенировании генома, позволил определить вирусы у 10 из 14 пациентов. Однако новый тест обнаружил вирусы и у четырех других детей. Стандартное тестирование не смогло выявить самые обычные вирусы: вирус гриппа В, вызывающий сезонную простуду, парэховирус – умеренный желудочно-кишечный и респираторный вирус, герпесвирус 1 типа, вызывающий герпес на губах, а также вирус ветряной оспы.

Во второй группе детей с необъяснимыми простудами стандартное тестирование выявило 11 вирусов у 8 обследованных. Однако новый тест позволил обнаружить еще 7, в том числе и респираторный аденовирус В человека типа 3А, обычно безвредный, но иногда вызывающий сильные инфекции у некоторых пациентов.

В итоге, число вирусов, выявленных в двух группах пациентов, возросло с 21 до 32, то есть, в данном случае, на 52%.

«Тест настолько чувствителен, что даже определяет варианты штаммов вирусов, родственных генетически, – отмечает один из авторов публикации Тодд Уайли (Todd Wylie), преподаватель педиатрии, – Небольшие генетические различия среди вирусов часто нельзя выявить доступными в настоящее время тестам».

Кроме того, в связи с тем, что тест содержит детальную генетическую информацию о различных штаммах отдельных вирусов, можно легко определить их подтипы. Например, исследование показало, что, в то время как стандартный анализ выявил вирус гриппа А, вызывающий сезонную простуду, новый метод диагностики указал, что данный вирус относится к особенно острому подтипу H3N2.

В прошлом эпидемиологическом сезоне H3N2 стал причиной некоторых из 36 тыс. смертельных случаев в США. У некоторых пациентов, в частности, у маленьких детей, пожилых людей и людей с ослабленной иммунной системой, информация о присутствии штамма H3N2 может повлиять на тактику лечения.

Для разработки теста исследователи собрали уникальные последовательности ДНК или РНК каждой из известных группы вирусов, инфицирующих человека и животных. В общей сложности исследовательская команда включила в исследование 2 млн. уникальных фрагментов генетического материала вирусов. Эти фрагменты используются в качестве проб для гибридизации генетического материала вирусов в образце. Соответствующий вирусный материал затем анализируется с использованием высокопроизводительного генетического секвенирования. При обнаружении абсолютно новых вирусов их генетический материал можно легко получить и добавить в тест-систему, отмечает Сторк.

Исследователи планируют провести дополнительные испытания для оценки точности теста, поэтому до его клинической доступности может пройти несколько лет.

«Можно модифицировать диагностическую систему так, чтобы она использовалась для определения патогенов, отличных от вирусов, как, например, бактерии, грибы и другие микроорганизмы, а также генов, указывающих на резистентность патогена к лечению антибиотиками или другими препаратами», – говорит соавтор публикации Кристин Уайли (Kristine Wylie), доктор философии, доцент педиатрии.

Todd N Wylie, Kristine M Wylie, Brandi N Herter, Gregory A Storch. Enhanced virome sequencing through solution-based capture enrichment. Genome Research, 2015; gr.191049.115 DOI: 10.1101/gr.191049.115

О admin

Оставить комментарий

x

Check Also

Контактные линзы

Контактные линзы — великолепная альтернатива очкам. Но какие лучше выбрать ? Каждые линзы имеют свои особенности, достоинства и недостатки? Попробуем разобраться и подобрать идеальный вариант. ...

Разбилась энергосберегающая лампа – порядок действий

Как действовать если разбилась энергосберегающая лампа Энергосберегающие лампы пользуются заслуженной популярностью, ведь они более экономичны и долговечны. Но мало кто знает, что энергосберегающие лампы содержат ...

Кремлевская диета: отзывы и фото похудевших

Вся правда о кремлевской диете: отзывы, меню и результаты похудевших с фото Кремлевская диета сродни многим белковым диетам, в основе которых лежит увеличенное содержание белков ...

5 лучших препаратов для лечения насморка у детей от 0 до 5 лет

5 лучших препаратов для лечения насморка у детей от 0 до 5 лет Насморк может настигнуть маленького ребёнка уже с первых недель жизни. Для карапуза ...

Мозоли на ногах: лечение в домашних условиях

Мозоли на ногах – это распространенная проблема, которая не представляет угрозы здоровью человека, но причиняет физический и моральный дискомфорт, поэтому требует лечения. Они возникают в ...

Метеозависимость – симптомы, лечение, как избавиться от метеозависимости?

Чувствительностью к погоде могут «похвастать» 75 человек из ста (согласно статистике). Причем, на здоровых людей погода практически не влияет, но только до тех пор, пока ...

Гормоны надпочечников и их функция

Парные эндокринные железы забрюшинного пространства – надпочечники. Эти небольшие органы расположены у человека, у верхнего края почек. Форма надпочечников: пирамида (правый) и полусфера (левый). Роль ...

Первая помощь при ДТП

Ежегодно в России в результате дорожно-транспортных происшествий (ДТП) погибают около 30 тысяч человек и свыше 250 тысяч получают ранения. Основными причинами смерти пострадавших в ДТП ...

8 лучших напитков для похудения – что пить, чтобы похудеть эффективно?

8 лучших напитков, помогающих похудеть – что же пить для похудения? Идеальный напиток для похудения – свежевыжатый сок! Его пектины помогают в очищении организма и ...

Как почистить печень от шлаков и токсинов: эффективные методы

Чем чистить печень в домашних условиях: лучшие методы Печень является органом-фильтром для организма, но, из-за различных внешних факторов и других реакций в организме, не всегда ...

Методы лечения кариеса у детей: причины, особенности, как лечить молочные и коренные зубы у ребенка?

Особенности лечения кариеса у детей: подходы и методы К сожалению, детский кариес распространен очень широко. Это самый частый повод для обращения к детскому стоматологу. Неверно ...

Лечение недержания мочи у женщин, выпадения влагалища и т

Intimalase и Incontilase – новейшие методики борьбы за женское здоровье Мочеполовые расстройства зачастую являются спутниками зрелости женского организма, и в большей степени проявляются в период ...

Боль в суставах: почему болят суставы, что делать и как можно избавиться от болей?

По статистике, с жалобами на боль в суставах — артралгию — обращается примерно 50% людей старше 40 лет, а после 70 лет симптом проявляется уже ...

Что такое миофасциальный подход и как использовать его в тренировках

Что такое миофасциальный подход и как использовать его в тренировках В основе миофасциального подхода лежит понятие фасции — соединительной ткани, в которую «упакованы» все элементы ...

История ядов, или хроники знаменитейших отравлений (Денис Дионисов)

Первые сведения об употреблении ядов мы находим в древнегреческих мифах. Своими любящими женами были отравлены величайшие герои Эллады – аргонавт Ясон и воитель Геракл. Они ...

Годжи: целебные свойства и применение ягоды годжи

Годжи – деревянистое растение широко известное в славянских странах под названием «дереза обыкновенная». Ягоды годжи нашли своё применение в качестве приправы в китайской народной кухне, ...

Признаки недостатка витаминов, какие витамины нужны зимой и осенью, необходимые витамины весной – на

Нехватка витаминов в организме: симптомы и необходимые продукты Признаки нехватки витаминов в организме Точный ответ на данный вопрос даст полный анализ крови. Но существуют очевидные ...

8 Лучших напитков для похудения – что пить, чтобы похудеть эффективно? Семья и дети 2017 – Модный Женский Журнал 2017

8 Лучших напитков для похудения – что пить, чтобы похудеть эффективно? Идеальный напиток для похудения – свежевыжатый сок! Его пектины помогают в очистке организма и ...

Первая помощь при ожогах – в домашних условиях, медицинская помощь

Ожоги относятся к серьезным физическим и моральным травмам: их получение сопровождается сильной болью и повреждениями разной степени тяжести, а после заживления на коже еще долго ...

Что делать если покраснел глаз и болит, как убрать покраснение?

Что делать, если покраснел глаз? Большинство считает, что такой синдром вызывает усталость и длительная работа за компьютером. Иногда это действительно так. Но этот синдром может ...

Как алкоголь влияет на иммунитет

Как алкоголь влияет на уровень иммунитета человека? Мнение специалистов о том, как алкоголь влияет на иммунитет, носит двойственный характер. Считается, что его большие порции угнетают ...

Тошнота и озноб

Иногда у человека проявляются неприятные симптомы тошноты и озноба. Но как показывает практика причин для такого плохо самочувствия крайне много. Давайте разберемся, о чем могут ...

Кишечные колики у новорожденных – причины появления, диета

Почему возникают и когда пройдут колики у грудничков – диета мамы и ребенка при коликах в животе у новорожденных Почти 70% новорожденных сталкиваются с коликами, ...

Ребенка укусил клещ – что делать?

При отдыхе на природе нередко родители обнаруживают у ребенка на теле внедрившегося кровососа – клеща. Укус этого насекомого может грозить ребенку заражением достаточно опасными инфекциями ...

Рейтинг@Mail.ru